Entityの一覧を取得する方法が分からなくて調べたのでメモ。
もっとスマートなやり方があるのかしらん。

$em = $this->getManater();
$metadata_array = $em->getMetadataFactory()->getAllMetadata();
foreach($metadata_array as $metadata){
  $entity_name = $metadata->getName();
}

これでエンティティ名が取れる。あとは、ロードを行うのであれば普通に

$em->getRepoisitory($entity_name)->findAll();

とか、

 $refl_class = new ReflectionClass($entity_name);
 $entity = $refl_class->newInstance();

とか色々できる。